9月8日，据日本共同社报道，新冠肺炎的疫情正在逐渐影响日本自卫队的活动。在日本即将被派往海外的护卫舰上，由于新冠肺炎感染者的诊断，连续两次推迟出发。目前，被感染的自卫队人员总数超过110人。

据报道，海上自卫队护卫舰Murayu号是第三批旨在确保日本相关船只安全的中东派遣队。8月30日，该护卫舰从横须贺基地出发，但9月1日，船上一人被诊断患有新冠肺炎。此后，护卫舰返回基地，要求受感染的小组下船，并讨论重新开始的时间。

七月早些时候，属于萨士堡基地的宙斯盾号脚把手"也出现了新冠肺炎的感染，新冠肺炎将参加夏威夷太平洋周围的联合演习(RIMPAC)推迟了10天。海上自卫队的干部透露："将来也可能发生这种情况。你只能在心理上做好准备来制定计划。

据报道，上述所有船只启航后不久都进行了聚合酶链反应(PCR)检测。这些船只原计划在日本沿海停留14天，在确认没有发生感染后，前往目的地。"派遣时间将延长，团队负担将增加，但重点是避免离开日本后出现集体感染的风险，"国防部的一名干部表示。

报告指出，为了防止部队流动，导致疫情蔓延，陆战自卫队彻底要求队员戴上口罩，并试图限制公路上休息站等私人设施的使用；训练场将帐篷住宿数量减少到低于额定数量，并注意保持社会距离。陆自卫队说："一方面，新冠肺炎的对策也造成了负担，但只能努力把活动考虑在内。

一名自卫队干部说，疫情的蔓延使美国航空母舰瘫痪，"新冠肺炎可能会严重限制自卫队的能力，必须保持高度警惕。